2000 - н.в. старший научный сотрудник ИППИ РАН
1982 - 2000. ВНИИ Железнодорожного транспорта МПС,
1972 - 1982. Главный Вычислительный Центр Госснаба СССР,
мехмат МГУ им. М.В. Ломоносова

Публикации:

Mazin P.V, Gelfand M.S, Mironov A.A, Rakhmaninova A.B, Rubinov A.R, Russell R.B, Kalinina O.V. An automated stochastic approach to the identification of the protein specificity determinants and functional subfamilies. Algorithms Mol Biol. 2010, 5: 29. PubMed  PDF

V. Ramensky, A. Sobol, N. Zaitseva, A. Rubinov, V. Zosimov. A novel approach to local similarity of protein binding sites substantially improves computational drug design results. Proteins. 2007, 69: 349-57. PubMed  PDF

S. Nikitin, N. Zaitseva, O. Demina, V. Solovieva, E. Mazin, S. Mikhalev, M. Smolov, A. Rubinov, P. Vlasov, D. Lepikhin, D. Khachko, V. Fokin, C. Queen, V. Zosimov. A very large diversity space of synthetically accessible compounds for use with drug design programs. J Comput Aided Mol Des. 2005, 19: 47-63. PubMed  PDF

Методы прогнозирования в организации пассажирских перевозок. Железнодорожный транспорт, 2004, 1:50-56 (соавт.: Ю.В.Елизарьев, Л.В. Максименко, Е.А. Юркова)

Факторная модель пассажирских перевозок. Экономика железных дорог, 2003, 9:67-82 (соавт.: Ю.В.Елизарьев, Л.В. Максименко, Е.А. Юркова)

Некоторые конструкции кодов, избегающих конфликты. Проблемы передачи информации, 2002, 38(4):24-36 (соавт.: Б.С. Цыбаков)

Задачи экономии ресурсов в организации пассажирских перевозок. В кн.: Ресурсосберегающие технологии на железнодорожном транспорте: Труды Всероссийской конференции. "Москва", 2000, с. 3-11 (соавт.: А.Д. Гаврилов, Ф.А. Хилькевич, А.П. Шулаков)

Пассажирский узел: АРМы технологов. Железнодорожный транспорт, 1999, 9:25 - 28 (соавт.: Э.Ю. Тимохин, А.Д. Гаврилов, Л.В. Максименко, А.П. Шулаков)

Методы организации технологических процессов пассажирского узла. Железнодорожный транспорт, 1999, 9:29-31 (соавт.: Э.Ю. Тимохин, А.Д. Гаврилов, Л.В. Максименко, А.П. Шулаков)

String Noninclusion Optimization Problems. SIAM Journal on Discrete Mathematics, 1998, 11(3):456-467 (with Timkovsky V.G.)

Rubinov AR, Gelfand MS. Reconstruction of a string from substring precedence data. J Comput Biol. 1995, 2(2):371-81. PubMed

Razgulyaev O, Rubinov A, Gelfand M, Chetverin A. Sequencing potential of nested strand hybridization. J Comput Biol. 1995, 2(2):383-95. PubMed

Комбинаторный метод сортировки вагонов. Вестник ВНИИЖТ, 1989, 9:1-8 (соавт.: Е.В. Кендыс, В.М. Макаров, Е.М. Тишкин)
(математическая часть этой статьи под названием "Optimal distribution sorting" опубликована в: "Translations of Mathematical Monographs Series" of AMS, Selected Topics in Discrete Mathematics, 1994, ser.2, vol. 158, pp. 175-183).

Rubinov AR, Kendys EV, Makarov VM, Tishkin EM. Optimal distribution sorting. "Translations of Mathematical Monographs Series" of AMS, Selected Topics in Discrete Mathematics. 1994, ser.2, vol. 158, pp. 175-183.

Rubinov AR. The optimal oligonucleotide linker. Abstr. of International Congress on Computer Systems and Applied Mathematics, St. Petersburg, 1993, p. 165-166.

Rubinov AR, Timkovsky VG. Non-similarity combinatorial problems. Biosystems. 1993, 30(1-3):81-92 PubMed

Методы последовательной балансировки и их использование для восстановления данных по агрегированной информации. Вестник ВНИИЖТ, 1990, 1:5–7 (соавт.: М.А. Пояркова, В.К.Тур)

Две оптимизационные задачи на деревьях. В кн.: Системы программного обеспечения задач оптимального планирования: Материалы Всесоюзной школы-семинара. Кострома, 1990, с. 117-125

Автоматизированная система корректировки плана формирования поездов. Железнодорожный транспорт. 1988, 12:6-9, (соавт.: Ю.М. Лангер, М.А. Пояркова, В.К. Тур).

Оптимальное использование ресурсов в планировании и управлении на железнодорожном транспорте. Вестник ВНИИЖТ. 1988, 8:6-14, (соавт.: Ю.М. Лангер, Е.А. Сотников, В.К. Тур)

Методы организации перевозок при ограниченных пропускных способностях железнодорожных линий. В кн.: Совершенствование хозяйственного механизма на железнодорожном транспорте: Труды ВНИИЖТ. 1987, Москва, с. 50-56

Оптимизация распределения погрузки по взаимозаменяемым типам вагонов на сети железных дорог. Вестник ВНИИЖТ. 1985, 8:4-10, (соавт.: Н.А. Воробъев, В.Д. Литвин)

Анализ системы грузовых перевозок и разработка методов их рационализации. Отчет о НИР, ВНИИЖТ, ЛЭ - 311 - 84 а, 1984. с. 1 - 55, (соавт.: Л.В. Канторович)

Магистральные свойства управляемых дискретных систем. В кн.: Оптимальные модели в системном анализе: Труды ВНИИСИ. Москва, 1983, c. 80 - 88

О сводимости обобщенной задачи коммивояжера к задаче коммивояжера меньшей размерности. Доклады АН СССР, 1982, т.264, № 5, с. 1087 - 1090

Теоремы о магистралях в обобщенных задачах коммивояжера и их применение к задачам раскроя и теории расписаний. Доклады АН СССР, 1981, т.259(3) с. 542 - 546

Раскрой полосы на фигурные заготовки. В кн.: Математическое обеспечение расчетов линейного и прямоугольного раскроя: Материалы Всесоюзного семинара. - Уфа, 1980, с. 130 - 136

Conferences

V. Ramensky, A. Rubinov, N. Zaitseva, V. Zosimov. Computational drug design based on a novel approach to local similarity of protein binding sites. Helmholtz Russian-German Workshop on Systems Biology. (Moscow, Russia, February 2008)

В. Раменский, Н. Зайцева, А. Рубинов, В. Зосимов. Новый подход к сравнению участков связывания в белках в задачах вычислительного конструирования лекарств. Информационные технологии и системы ИТиС’07. 30-я конференция молодых ученых и специалистов ИППИ РАН. (Звенигород, сентябрь 2007).

V.E. Ramensky, N.I. Zaitseva, A.R. Rubinov, V.V. Zosimov. Computational drug design based on a novel approach to local similarity of protein binding sites. Fourth International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources. (Moscow, Russia, September, 2007)

V.E. Ramensky, A. Sobol, N.I. Zaitseva, A.R. Rubinov, V.V. Zosimov. A novel approach to local similarity of protein binding sites and its application to computational drug design. 3rd Int. Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB’07 (Moscow, Russia, July 2007).