Московский семинар

по биоинформатике


Новости

Контакты

Схема проезда:

ИМБ

ФБиБи, МГУ


Статья о семинаре


  2016   2015   2014   2013   2012   2011   2010   2009   2008   2007   2006   2005   2004   2003   2002   2001   2000   1999   1998   1997   1996   1995   1994   1993

семинар 306

Среда, 16 марта 2016, 18.00 МГУ, Лаб. корпус Б (факультет биоинженерии и биоинформатики), к. 221.

Константин Попадьин

Математический институт им. Стеклова, Москва

Центр Интегративной Геномики, Университет Лозанны, Швейцария


Широко известно, что во время эмбриогенеза естественный отбор может эффективно элиминировать наименее приспособленные эмбрионы. Так, например, геномы нежизнеспособных (подвергшихся спонтанному абортированию) эмбрионов, намного чаще содержат крупные хромосомные аберрации, нежели геномы жизнеспособных эмбрионов. Однако, совсем ничего не известно о различиях между выжившими и невыжившими эмбрионами, содержащими одну и ту же хромосомную аберрацию. Рассматривая трисомию хромосомы 21 (синдром Дауна), которая характеризуется 80% вероятностью самопроизвольного аборта, я предлагаю гипотезу, согласно которой суммарный груз слабовредных мутаций может оказаться решающим в судьбе эмбриона. Анализируя генетические и транскриптомные данные когорты европейцев с синдромом Дауна, я представлю несколько свидетельств существования класса мутаций, которые увеличивают вероятность живорождения эмбрионов с трисомией. Причем механизм этой компенсации может базироваться как на увеличении частоты условно полезных вариантов (мутации, присутствие которых увеличивает вероятность выжить только при условии трисомии, но нейтральные в отсутствии трисомии) так и на уменьшении частоты безусловно-вредных мутаций (вредные всегда). Пониженная частота безусловно-вредных мутаций мне наиболее интересна и, используя простую математическую модель, я обсуждаю гипотезу генетического гандикапа, согласно которой носитель вредной мутации (генетического гандикапа) может обладать пониженным грузом слабовредных мутаций по сравнению с контрольной (здоровой) популяцией.
обратите внимание на нестандартный день - среда!

© Seminar, 1993 - 2016