Публикации:

Rodionov D.A, Novichkov P.S, Stavrovskaya E.D, Rodionova I.A, Li X, Kazanov M.D, Ravcheev D.A, Gerasimova A.V, Kazakov A.E, Kovaleva G.Y, Permina E.A, Laikova O.N, Overbeek R, Romine M.F, Fredrickson J.K, Arkin A.P, Dubchak I, Osterman A.L, Gelfand M.S. Comparative genomic reconstruction of transcriptional networks controlling central metabolism in the Shewanella genus. BMC Genomics. 2011, 12 Suppl 1: S3. PubMed  PDF

 Novichkov P.S, Rodionov D.A, Stavrovskaya E.D, Novichkova E.S, Kazakov A.E, Gelfand M.S, Arkin A.P, Mironov A.A, Dubchak I. RegPredict: an integrated system for regulon inference in prokaryotes by comparative genomics approach. Nucleic Acids Res. 2010, 38: W299-307. PubMed  PDF

Feklistov A, Barinova N, Sevostyanova A, Heyduk E, Bass I, Vvedenskaya I, Kuznedelov K, Merkiene E, Stavrovskaya E, Klimasauskas S, Nikiforov V, Heyduk T, Severinov K, Kulbachinskiy A. A basal promoter element recognized by free RNA polymerase sigma subunit determines promoter recognition by RNA polymerase holoenzyme. Mol Cell. 2006, 23(1):97-107. PubMed  PDF

Е.Д. Ставровская, ВЮ. Макеев, АА. Миронов ClusterTree-RS: алгоритм кластеризации регуляторных сигналов с помощью бинарного дерева. Молекулярная биология. 2006, 40(3): 465-473 PubMed 

Stavrovskaya ED, Mironov AA. Clustering regulatory signals by binary trees. Biophysics (Moscow), 2003, 48 Suppl. 1 S17-S20 PDF

Stavrovskaya ED, Mironov AA. Two genetic algorithms for identification of regulatory signals. In Silico Biol. 2003, 3(1-2):49-56 PubMed  PDF

Патенты:

АА. Миронов, ЕД. Ставровская, ВЮ. Макеев. (2006) Способ исследования совместной регуляции генов бактерий и прогнозирования содержания новых регулонов и функций генов. Патент 2006127264/13 (вх. 029628)

Конференции:

Е.Д. Ставровская, Д.А. Родионов, А.А. Миронов, И. Дубчак, Новичков П. Предсказание состава регулона с помощью метода автоматического определения порога. Оценка качества позиционной весовой матрицы. Труды конференции Информационные технологии и Системы (ИТИС'11). с. 325-328. 2 - 7 октября 2011г., Геленжик, Россия

Е.Д.Ставровская, Д.А.Родионов, А.А. Миронов, И. Дубчак, П.С.Новичков. Вероятностный подход для выявления состава регулона. Различные способы определения меры принадлежности гена к регулону. Конференция молодых ученых и специалистов ИППИ РАН ИТиС'10, с. 401-403, 20 - 24 сентября 2010г., Геленджик, Россия

Д. Митева, Е. Ставровская, А. Б. Рахманинова, А.А. Миронов. Поиск сигналов инициации трансляции у Cyanobacteria. Конференция молодых ученых и специалистов ИППИ РАН ИТиС'10, с. 352-353, 20 - 24 сентября 2010г., Геленджик, Россия

А.П. Гайдукова, Е.Д. Ставровская, А.А. Миронов. Инструментальное средство поиска регуляторных мотивов в геномах. Конференция молодых ученых и специалистов ИППИ РАН ИТиС'10, с. 385-386, 20 - 24 сентября 2010г., Геленджик, Россия

E. Stavrovskaya, D.A. Rodionov, A.A. Mironov, I. Dubchak, P.S. Novichkov. Iterative Statistical Approach for Discovering Evolutionary Conserved Members of Regulon. Proceedings of the conference Information Technologies and Systems (ITaS'09). P. 324-32, 15-18 December 2009, Bekasovo, Russia

E. Stavrovskaya, D.A. Rodionov, A.A. Mironov, I. Dubchak, P.S. Novichkov. Statistical approach for discovering evolutionary conserved members of regulon. Proc. Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'09). P. 336-338. July 20-23, 2009, Moscow, Russia

P.S. Novichkov, E.D. Stavrovskaya, M.S. Gelfand, A.A. Mironov, I. Dubchak, D.A. Rodionov. Platform for the accurate semi-automatic inference of regulons by comparative genomics approach. Proc. RECOMB 2009, May 2009, Tucson, USA

Е.Д. Ставровская, М. Сиприано, И.Л. Дубчак, А.А. Миронов, М.С. Гельфанд. Автоматический поиск регуляторных сигналов перед генами в рамках функциональных подсистем. Информационные технологии и системы ИТиС’07 (Звенигород, сентябрь 2007). (доклад) с. 330-331

E. Stavrovskaya, M. Cipriano, I.L. Dubchak, A.A. Mironov, M.S.Gelfand. Automated search for regulatory motifs in upstream regions of genes from the functional subsystems. 3rd Int. Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB’07 (Moscow, Russia, July 2007). (poster) p. 283

E.D. Stavrovskaya, V.J. Makeev, I.V. Merkeev, A.A. Mironov. Tool for Automatic Detection of Co-regulated Genes. Proceedings of 5th European Conference on Computational Biology ECCB’2006 (Eilat, Israel January 2007). (poster)

ED. Stavrovskaya, VJ. Makeev, IV Merkeev, AA. Mironov. Tool for automatics detection of co-regulated genes. Proceedings of 5th Int. Conf. on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure BGRS'2006 (Novosibirsk, July 2006)

E.D. Stavrovskaya, V.J. Makeev, A.A. Mironov. ClusterTree-RS: The binary tree algorithm for identification of co-regulated genes by clustering regulatory signals. Proceedings of the international conference MCCMB’2005; 385

Е.Д. Ставровская, А.А. Миронов. ClusterTree: программа кластеризации регуляторных сигналов с помощью бинарного дерева. Материалы XII Международной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов», 2005; 36-37

E.D. Stavrovskaya, A.A. Mironov. Binary tree for clustering of regulatory signals. Proceedings of the international conference BITS’2005; 85

E.D. Stavrovskaya, A.A. Mironov. Binary tree for clustering of regulatory signals. Proceedings of the fourth international conference BGRS’2004; V. 1: 195-199

E.D. Stavrovskaya, A.A. Mironov. Binary tree for clusterization of regulatory signals. Proceedings of the international conference MCCMB’03 2003; 218-219

E.D. Stavrovskaya, A.A. Mironov. A genetic algorithm for identification of regulatory signals. Proceedings of the third international conference BGRS’2002; V. 1: 26-27

Награды

ЕД. Ставровская (аспирант ИППИ РАН). Победа в конкурсе "Гранты Москвы - 2005". ISSEP (Международная Соросовская программа образования в области точных наук).

ЕД. Ставровская. Премия "Лучшие аспиранты РАН" (технические науки) от Фонда поддержки отечественной науки (2005)